pymol是一款功能十分強(qiáng)大的三維分子模型分析軟件，該軟件集成了最新的光線追蹤技術(shù)，內(nèi)置了豐富的小工具合集，能夠幫助用戶輕松地搭建出分子模型，操作簡單易上手，可根據(jù)用戶的需求搭建出各種規(guī)格的3D分子模型，今天小編為大家?guī)砹诉@款軟件的教育版，該版本專門針對(duì)高校用戶量身定制，喜歡的小伙伴千萬不要錯(cuò)過哦。

【軟件特色】

　　借助此分子可視化系統(tǒng)，可以以3D模式對(duì)蛋白質(zhì)，其密度，軌跡和表面進(jìn)行細(xì)微分析

　　原生視網(wǎng)膜分辨率/ 4k顯示支持

　　新的APBS插件面板

　　pymolrc腳本編輯器，突出顯示語法

　　停靠/取消停靠并重新排列某些面板(生成器，反饋瀏覽器，音量編輯器)

　　支持觸控板手勢(捏放大/縮小，z旋轉(zhuǎn))

　　用于打開MAE文件，MTZ文件，地圖和軌跡文件的專用對(duì)話框

【安裝教程】

　　Window系統(tǒng)的pymol運(yùn)行需要依賴python環(huán)境，PMW模塊。

　　而Pymol的安裝是通過一個(gè)python包（Python Wheels）安裝的，因此在開始之前，我們需要根據(jù)系統(tǒng)的位數(shù)（32位還是64位）以及python的版本來選擇pymol包進(jìn)行下載。

　　比方說，系統(tǒng)是windows 64位，系統(tǒng)中有python 3.7（或者打算安裝python 3.7），那么我們就可以有2個(gè)選擇，可以選擇下載pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl或者pymol-2.4.0a0-cp37-cp37m-win_amd64.whl，對(duì)應(yīng)的版本分別是pymol 2.3和pymol 2.4.

　　安裝python環(huán)境

　　1、如果系統(tǒng)中已經(jīng)有了python環(huán)境，則跳過這一步。可以通過命令行：python –V來查看python的版本號(hào)。

　　2、進(jìn)入python官網(wǎng)下載windows版的安裝包

　　3、注意的是下載的安裝包要和windows系統(tǒng)位數(shù)對(duì)應(yīng)，x86對(duì)應(yīng)的是32位系統(tǒng)；x86-64對(duì)應(yīng)的是64位系統(tǒng)，我們就以python 3.7為例，由于我們的系統(tǒng)是64位的，4、所以下載的安裝包為：Windows x86-64 executable installer

　　5、下載完成后，雙擊進(jìn)行安裝，記得勾選上Add Python to environment variables，不然后續(xù)命令行操作會(huì)出現(xiàn)問題。

　　6、如果安裝成功，Win+R，cmd進(jìn)入命令行，鍵入python –V就可以看到python的版本號(hào)，同時(shí)也說明安裝成功。如果報(bào)錯(cuò)“python不是內(nèi)部或外部命令，也不是可運(yùn)行的程序或批處理文件。”那么說明python的地址沒有加入環(huán)境變量。

　　安裝PMW

　　命令行鍵入：python -m pip install pmw

　　提示說成功安裝pmw，Successfully installed pmw-2.0.1

　　下載并安裝pymol包

　　根據(jù)系統(tǒng)位數(shù)和python版本選擇某個(gè)pymol包進(jìn)行下載，放在某個(gè)磁盤根目錄。在這里，我們選擇安裝pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl，并放在D:/根目錄。

　　命令行下，將盤符切換到D:盤，鍵入命令：python -m pip  install pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl

　　提示安裝成功

　　找到pymol主程序的位置

　　本文中pymol的主程序地址為：C:\Users\Python37\Scripts\pymol.exe

　　其中紅色背景部分應(yīng)該會(huì)與不同電腦設(shè)置及python版本相一致。